2001-06 Ένα νέο ξεκίνημα
Με νέα ιδιοκτησία, τον τότε πρόεδρο της ποδοσφαιρικής ομάδας Γιώργο Μπατατούδη, ρόστερ εκατοντάδων εκατομμυρίων (Λιαδέλης, Σιγάλας, Κορωνιός, Κολντεμπέλα), αρχηγό πλέον το Γιάννη Γιαννούλη, προπονητή ξανά τον Κώστα Φλεβαράκη (με τον οποίο είχε κατακτήσει το Κύπελλο του ΄99) και πολλά όνειρα ο ΠΑΟΚ ξεκινά τη σεζόν 2000-01 για να κατακτήσει και την Ευρώπη, αλλά μένει από… βενζίνη πολύ γρήγορα και το όνειρο γίνεται εφιάλτης.
Την ίδια τύχη θα έχουν όλες οι προσπάθειες που ακολούθησαν. Η πορεία προς την ειδική εκκαθάριση είναι μία κακή ανάμνηση για όλους. Η ομάδα περνά πολύ δύσκολες στιγμές, με τεράστια οικονομικά προβλήματα και από την αρχή της περιόδου 2001-02 έχει διοίκηση διορισμένη από το Πρωτοδικείο και πρόεδρο τον Βασίλη Οικονομίδη, που ξεκινά τη σεζόν με προπονητή το Λευτέρη Σούμποτιτς και την ολοκληρώνει με τον Βαγγέλη Αλεξανδρή. Η ειδική εκκαθάριση δίνει στον ΠΑΟΚ τη δυνατότητα να ξεκινήσει και πάλι από την αρχή κι αυτό ακριβώς γίνεται… Βασιζόμενος στα νέα του παιδιά (Βασιλειάδης, Βασιλόπουλος, Μαυροκεφαλίδης), με προπονητή πλέον τον Μπάνε Πρέλεβιτς και από τις 17 Ιανουαρίου 2004 τον Τάκη Πανελούδη στην ιδιοκτησία της νέας ΚΑΕ, ο ΠΑΟΚ ξεκινά και πάλι από την αρχή. Η προσπάθεια δεν ολοκληρώνεται όπως θα περίμενε κανείς και κυρίως οι φίλαθλοι της ομάδας που στήριξαν όπως πάντα το νέο ξεκίνημα.
2007-08 Στο χείλος του γκρεμού
H σεζόν 2007-08 ήταν μία από τις χειρότερες στην ιστορία του ΠΑΟΚ. Ξεκινώντας με τον Αμερικανό προπονητή Ταμπ Μπάλντγουΐν και την ελπίδα ότι θα βρει το δρόμο του, ο ΠΑΟΚ βρίσκεται από πολύ νωρίς αντιμέτωπος με την σκληρή πραγματικότητα, να παλεύει για την παραμονή του στην κατηγορία. Με τον Κώστα Φλεβαράκη να αναλαμβάνει την τεχνική ηγεσία της ομάδας, ο ΠΑΟΚ επανέρχεται στο σωστό δρόμο, αλλά και πάλι φτάνει στο σημείο να παίξει την επιβίωσή του στις τελευταίες αγωνιστικές της σεζόν.
Ο Νίκος Σταυρόπουλος μαζί με τον Τζον Κόρφα και τον Χρήστο Κωνσταντινίδη, αναλαμβάνουν να καθοδηγήσουν την ομάδα στις τελευταίες τρεις αγωνιστικές, ο ΠΑΟΚ με πολύ κόπο και τρομερή αγωνία πετυχαίνει τον στόχο του στην τελευταία μέρα του πρωταθλήματος και αποχαιρετά με πολύ άσχημες αναμνήσεις, μία εξαιρετικά δύσκολη χρονιά.
2011 Ο ΠΑΟΚ επιστρέφει…
Οι σοβαρές περιπέτειες της διετίας 2007-09, μπήκαν οριστικά στο περιθώριο, όταν από το καλοκαίρι του 2009 ο ΠΑΟΚ, απέκτησε ξανά διοίκηση Πρωτοδικείου (αρχικά με τον Μιλτιάδη Κανώτα σε ρόλο προέδρου), με το Νίκο Σταυρόπουλο να ηγείται της νέας προσπάθειας από τη θέση του τεχνικού διευθυντή και να επιλέγει ως προπονητή το Σούλη Μαρκόπουλο, που έναν χρόνο νωρίτερα είχε αναδειχθεί κορυφαίος προπονητής στην Ελλάδα. Σε πολύ σύντομο χρονικό διάστημα ο ΠΑΟΚ βρήκε το δρόμο του και το έκανε με τρόπο εντυπωσιακό.
Στο ξεκίνημα της σεζόν 2009-10, ο ΠΑΟΚ πέτυχε μία ιστορική νίκη επί του Άρη, με την διαφορά ρεκόρ (83-48) των 35 πόντων, που μέχρι και σήμερα αποτελεί την μεγαλύτερη στην ιστορία των αναμετρήσεων των δύο ομάδων. Και την επόμενη χρονιά, παρά το γεγονός ότι χρειάστηκε να ξεπεράσει αρκετές δύσκολες στιγμές, ο ΠΑΟΚ κατέκτησε την 3η θέση στο πρωτάθλημα και μαζί το δικαίωμα να διεκδικήσει την επιστροφή του στην Ευρωλίγκα, μέσα όμως από την εξαιρετικά δύσκολη διαδικασία των προκριματικών. Η 3η θέση του 2011, ήταν η αρχή μίας ανοδικής πορείας, αλλά αποδείχθηκε και μία αγαπημένη συνήθεια για τον ΠΑΟΚ τα επόμενα χρόνια.
2014-15 Και πάλι τρίτος…
Από το καλοκαίρι του 2011, δίπλα στο Νίκο Σταυρόπουλο, το Σούλη Μαρκόπουλο και τον Τέλη Ζουρνατσίδη, ήρθε και ο Μπάνε Πρέλεβιτς, ο οποίος επέστρεψε στην ομάδα, αυτή η την φορά από τη θέση του προέδρου. Ο Σούλης Μαρκόπουλος έμεινε για οκτώ συνεχόμενα χρόνια στον πάγκο της ομάδας, καταγράφοντας μοναδικά ρεκόρ στην ιστορία του ΠΑΟΚ και του Ελληνικού μπάσκετ. Έγινε ο μακροβιότερος προπονητής στην ιστορία του ΠΑΟΚ και ταυτόχρονα ο προπονητής με τα περισσότερα παιχνίδια στη μεγάλη κατηγορία στην ιστορία του Ελληνικού μπάσκετ.
Το 2014 ο ΠΑΟΚ έφτασε και πάλι στην κατάκτηση της 3ης θέσης και με συνέπεια, αλλά και μία απόλυτα υγιή εικόνα, εντός και εκτός παρκέ, το επανέλαβε και την επόμενη χρονιά. Και το 2015 ο ΠΑΟΚ ήταν στη 3η θέση του πρωταθλήματος, ενώ παράλληλα άρχισε να δείχνει μία εντυπωσιακή συνέπεια και με την ευρωπαϊκή του πορεία. Το αποδεικνύει το γεγονός ότι για πέντε συνεχόμενα χρόνια προκρίθηκε στην επόμενη φάση της Ευρωπαϊκής διοργάνωσης που συμμετείχε, δημιουργώντας πλέον την εντύπωση ότι πλησιάζει η στιγμή για το κάτι παραπάνω.
2016 Τα 90 χρόνια του ΠΑΟΚ
Ο ΠΑΟΚ γιόρτασε τα 90 του χρόνια, με μία σειρά εκδηλώσεων σε όλη τη διάρκεια του 2016. Η αρχή έγινε τον Απρίλιο του 2016, με την εκδήλωση όλου του συλλόγου στο Μέγαρο Μουσικής Θεσσαλονίκης, για να ακολουθήσει η κορυφαία εκδήλωση όλων, το φιλικό παιχνίδι της ομάδας μπάσκετ του ΠΑΟΚ με την πρωταθλήτρια Ευρώπης ΤΣΣΚΑ Μόσχας. Οι μεγαλύτερες μορφές στην ιστορία του μπασκετικού ΠΑΟΚ πάτησαν και πάλι στο παρκέ, γνώρισαν την αποθέωση από τον κόσμο που είχε γεμίσει το «Παλατάκι» και απόλαυσαν μία μοναδική βραδιά, που όμοια της δεν είχε συμβεί ξανά. Στο επίκεντρο βρέθηκε και ο μεγαλομέτοχος της ΠΑΕ ΠΑΟΚ κ.Ιβάν Σαββίδης, που τιμήθηκε από την ΚΑΕ ΠΑΟΚ και συναντήθηκε για πρώτη φορά με όλες τις μεγάλες μορφές της ιστορίας του μπασκετικού ΠΑΟΚ.
Οι εκδηλώσεις της ομάδας μπάσκετ για την συμπλήρωση των 90 χρόνων από την ίδρυση του συλλόγου, ολοκληρώθηκαν το Δεκέμβριο του 2016, όταν και παρουσιάστηκε το εκπληκτικό λεύκωμα «Οι Πρωταγωνιστές: 90 χρόνια καλαθοσφαίρισης», το οποίο επιμελήθηκε ο Νίκος Σταυρόπουλος. Πρόκειται για ένα λεύκωμα, μοναδικό σε μέγεθος, σημασία και οπτικό υλικό, το οποίο παρουσιάζει όλη την ιστορία της ομάδας μπάσκετ του ΠΑΟΚ μέσα από σπάνιες φωτογραφίες, προσωπικές στιγμές και φυσικά, όλα εκείνα που συνέβησαν στο πέρασμα των χρόνων και έχουν μείνει βαθιά χαραγμένα στο μυαλό όλων.
2019 Στον τελικό μετά από 20 χρόνια
Από το Μάιο του 2017, ο ΠΑΟΚ μπήκε σε μία διαφορετική κατάσταση, καθώς μετά από 8 χρόνια συνεργασίας με την ομάδα, ήρθε η ώρα της αποχώρησης του Σούλη Μαρκόπουλου. Τη θέση του ρέκορντμαν στην ιστορία του ελληνικού πρωταθλήματος, πήρε ο Ηλίας Παπαθεοδώρου, ένας από τους καλύτερους νέους προπονητές στην Ελλάδα. Παρά το γεγονός ότι το ξεκίνημα αυτής της συνεργασίας συνδυάστηκε με άσχημες και σκληρές ήττες σε όλα τα επίπεδα, η σεζόν 2017-18 ολοκληρώθηκε με τον ΠΑΟΚ να σαρώνει κάθε αντίπαλο που βρήκε μπροστά του και να κατακτά (με μειονέκτημα έδρας) την 3η θέση.
Και η δεύτερη χρονιά της συνεργασίας της ΚΑΕ ΠΑΟΚ με τον Ηλία Παπαθεοδώρου προσέφερε δυνατές συγκινήσεις. Για 5η συνεχόμενη χρονιά ο ΠΑΟΚ προκρίθηκε στην επόμενη φάση της Ευρωπαϊκής διοργάνωσης στην οποία συμμετείχε, ενώ για πρώτη φορά μετά από 20 χρόνια, εξασφάλισε και την συμμετοχή του στον τελικό του Κυπέλλου Ελλάδας. Ο ΠΑΟΚ άγγιξε το μεγάλο τρόπαιο, έφτασε πολύ κοντά στη νίκη, αλλά έμεινε με την πίκρα για την τεράστια ανατροπή που έκανε και την καθολική αναγνώριση που υπήρξε για την συγκλονιστική προσπάθεια όλης της ομάδας.
2020-2025 Η πανδημία και ένας ευρωπαϊκός τελικός μετά από 29 χρόνια
Η σεζόν 2019-2020 αποτέλεσε μια δύσκολη δοκιμασία για τον ΠΑΟΚ, αλλά και για ολόκληρο τον κόσμο, λόγω της πανδημίας. Αυτό είχε ως αποτέλεσμα τη διακοπή του Πρωταθλήματος, καθώς και όλων των διοργανώσεων. Το καλοκαίρι του 2020 ήταν η περίοδος που άλλαξαν τα πάντα, όταν ο Θανάσης Χατζόπουλος ανέλαβε τα ηνία της ομάδας σε μια εξαιρετικά δύσκολη συγκυρία.
Παρά το κακό ξεκίνημα στη σεζόν 2020-21, η ομάδα μας άρχισε να ακολουθεί ανοδική πορεία, με τον προπονητή Λυκογιάννη να αναλαμβάνει την τεχνική ηγεσία από τον Δεκέμβριο του 2020. Μετά από απουσία ενός έτους, η επιστροφή στις ευρωπαϊκές διοργανώσεις αποτέλεσε την επιβεβαίωση της επανεκκίνησης του ΠΑΟΚ και η συμμετοχή της ομάδας σε έναν ευρωπαϊκό τελικό και πάλι μετά από 29 χρόνια, δημιούργησε ξανά μεγάλες προσδοκίες. Ο ΠΑΟΚ αντιμετώπισε τη Μπιλμπάο στους διπλούς τελικούς του FIBA Europe Cup τον Απρίλιο του 2025 και παρά το γεγονός ότι δεν κατάφερε να σηκώσει το τρόπαιο, έγινε ξανά σημείο αναφοράς εντός και εκτός της ασπρόμαυρης οικογένειας.
2025-26 Η νέα εποχή
Η σεζόν 2025-26, έχει έτσι κι αλλιώς ιστορική σημασία για τον ΠΑΟΚ, δεδομένου ότι ο σύλλογος συμπληρώνει έναν αιώνα ζωής. Από το Δεκέμβριο του 2025 ξεκίνησε η νέα εποχή του ΠΑΟΚ, με την έλευση του κ. Αριστοτέλη Μυστακίδη. Η ΚΑΕ ΠΑΟΚ άνοιξε ένα νέο κεφάλαιο στην ιστορική της πορεία. Λίγο πριν από τη συμπλήρωση 100 ετών από την ίδρυση του συλλόγου, η αλλαγή του ιδιοκτησιακού καθεστώτος σηματοδοτεί ένα νέο ιστορικό βήμα: με σεβασμό στο παρελθόν, πίστη στο παρόν και ξεκάθαρη προοπτική για το μέλλον.